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上海阿趣生物科技有限公司

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Small RNA是一大类调控分子,几乎存在于所有的生物体中。Small RNA包括:miRNA,ncRNA,siRNA,snoRNA,piRNA,rasiRNA等。
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产品: 浏览次数:990Small RNA是一大类调控分子,几乎存在于所有的生物体中。Small RNA包括:miRNA,ncRNA,siRNA,snoRNA,piRNA,rasiRNA等。 
品牌: biotree
型号: 请询本公司
规格: 请询本公司
单价: 面议
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有效期至: 长期有效
最后更新: 2014-10-09 11:51
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详细信息
Small RNA是一大类调控分子,几乎存在于所有的生物体中。Small RNA包括:miRNA,ncRNA,siRNA,snoRNA,piRNA,rasiRNA等。Small RNA通过多种多样的作用途径,包括mRNA降解、翻译抑制、异染色质形成以及DNA去除,来调控生物体的生长发育和疾病发生。Small RNA高通量测序作为鉴定和定量解析small RNA的新方法和有力工具,实验时首先将18-30 nt范围的Small RNA从总RNA中分离出来,两端分别加上特定接头后体外反转录成cDNA,进一步处理后利用测序仪对DNA片段进行单向末端测序。
一、技术路线和方法:

二、生物信息学分析
2.1 基本数据分析
Part01:测序质量评估
Part02:测序结果分类
Part03:microRNA表达量计算
Part04:microRNA差异表达分析
Part05:差异microRNA靶基因预测
Part06:靶基因GO分类
Part07:靶基因pathway分析
Part08:microRNA与靶基因调控网络构建
 
2.2 高级数据分析
Part09:新microRNA预测
Part10:转录因子预测分析
Part11:microRNA SNP分析
Part12:micrRNA 进化分析
三、二代测序平台

Illumina平台 测序平台 模式 数据量 一个lane
样品数
货号
SmallRNA-seq Hiseq2000 1×50 3-4M reads 12 BT2000211
SmallRNA-seq GAII 1×60 8Mreads 4 BT2000212

四、完成时间
3个月,(其中生物信息分析1个月)
所有版权及解释权归BIOTREE公司所有!
 
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